РФС снова запретил ФК «Томь» регистрировать новых футболистов, из-за больших долгов по заработной плате. В конце декабря руководство клуба заявило, что долги будут выплачены в I квартале 2017 года, но пока средства не поступили. Отчаявшись получить свои деньги, футболист Андрея Лях подал жалобу в Палату по разрешению споров Российского футбольного союза. В итоге РФС удовлетворил требования футболиста о выплате долгов по зарплате за июнь-август 2016 года, возмещении расходов на авиаперелеты и медицинские услуги, о компенсациях за неиспользованный отпуск, досрочное расторжение трудового договора и за задержку выплаты долгов. Кроме этого клубу запрещено регистрировать новых футболистов.
