Водные маршруты проложены в семи районах региона. Сотрудники Почты России доставляют грузы жителям отдалённых и труднодоступных населённых пунктов. Среди таких поселений - село Тискино Колпашевского района и посёлок Центрополигон Тегульдетского района.
Один из самых трудоёмких речных маршрутов находится в Каргасокском районе: от пристани райцентра до села Тымск и обратно. Почтовый груз перевозят на теплоходе, дорога в один конец занимает около семи часов. За каждый такой рейс по воде доставляют корреспонденцию и необходимые товары: сахар, муку, чай, консервы, крупы, кондитерские изделия.
Всего почтовики еженедельно совершают около 20 рейсов по рекам Кеть, Чулым, Обь, Четь, Васюган и Парабель. В отдалённые сёла доставляются письма, посылки, печатные издания и продукты с товарами первой необходимости.